Утвърждава и регистрира цените на лекарствените продукти и включва продукти в Позитивния лекарствен списък
Орган, пред който могат да се обжалват решенията на Националния съвет по цени и реимбурсиране на лекарствените продукти
Дава становища по деонтологични и етични въпроси в областта на клиничните изпитвания, когато е сезирана от комисиите по етика
Обсъжда и дава становища по насоки, приоритети, програми и нормативни актове в областта на фармацията
Изразява експертни становища в областта на превенцията на ХИВ/СПИН; епидемиологичния надзор и политиката за изследване в областта
Подпомага Министерството при дейността му по превенция и контрол, епидемиологичен надзор, лечение и медицински грижи в областта на туберколозата
Обсъжда и дава становища по основните насоки и приоритети в областта на лечение на зависимости
Управлява и координира Националната програма за редки болести, която има за цел навременната профилактика и диагностика на редки болести